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정수처리 관련 병원균은 수인성 질환을 유발하는 세균(대장균·살모넬라), 바이러스(노로·장바이러스), 원생동물(크립토스포리디움·지아디아)로 분류된다. 특히 크립토스포리디움·지아디아의 포낭(oocyst)은 염소 소독에 강한 내성을 가져 막여과·오존·자외선 소독 등 다중방벽(multi-barrier)이 필요하다. 응집·침전·여과의 물리적 제거와 소독을 결합한 정수처리기준(불활성화비, CT값) 준수가 핵심 대책이다.
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