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소독은 물리적 방식(자외선·가열·막여과)과 화학적 방식(염소·오존·이산화염소·클로라민)으로 구분한다. 염소는 잔류성·경제성이 우수하나 소독부산물(THM·HAA)이 단점이고, 오존은 강력한 산화·바이러스 제거에 우수하나 잔류성이 없고 브롬산염을 생성한다. 이산화염소는 THM 저감·잔류성이 있으나 아염소산염 부산물이 문제이며, 자외선은 부산물이 없고 크립토스포리디움 불활성화에 탁월하나 잔류소독력이 없다. CT값 개념으로 소독효율을 평가한다.
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